ความเชื่อมโยงที่ชัดเจนระหว่างการใช้ยาปฏิชีวนะกับความเสี่ยงที่เพิ่มขึ้นของการเกิดมะเร็งลำไส้ใหญ่ภายในห้าถึงสิบปีข้างหน้า สิ่งนี้ได้รับการยืนยันโดยนักวิจัยจากมหาวิทยาลัยอูเมโอ ประเทศสวีเดน หลังจากการศึกษาผู้ป่วยมะเร็ง 40,000 ราย ผลกระทบของยาปฏิชีวนะต่อไมโครไบโอมในลำไส้นั้นคิดว่าอยู่เบื้องหลังความเสี่ยงที่เพิ่มขึ้นของโรคมะเร็ง

ผลการวิจัยเน้นย้ำถึงข้อเท็จจริงที่ว่ามีเหตุผลหลายประการที่ต้องจำกัดการใช้ยาปฏิชีวนะ แม้ว่าในหลาย ๆ กรณีการรักษาด้วยยาปฏิชีวนะเป็นสิ่งจำเป็นและช่วยชีวิตได้ แต่ในกรณีที่มีโรคร้ายแรงน้อยกว่าที่คาดว่าจะหายได้ก็ตาม ควรใช้ความระมัดระวังข้างต้น ทั้งหมดเพื่อป้องกันแบคทีเรียจากการดื้อยา แต่จากการศึกษานี้แสดงให้เห็นว่า ยาปฏิชีวนะอาจเพิ่มความเสี่ยงของมะเร็งลำไส้ใหญ่ในอนาคต นักวิจัยพบว่าทั้งผู้หญิงและผู้ชายที่ใช้ยาปฏิชีวนะมานานกว่า 6 เดือนมีความเสี่ยงที่จะเป็นมะเร็งในลำไส้ใหญ่เพิ่มขึ้น 17% ซึ่งเป็นส่วนแรกของลำไส้ใหญ่ที่จะไปถึงได้ด้วยอาหารหลังลำไส้เล็ก มากกว่าผู้ที่ไม่ได้รับ กำหนดยาปฏิชีวนะใด ๆ อย่างไรก็ตาม ไม่พบความเสี่ยงที่เพิ่มขึ้นสำหรับมะเร็งในลำไส้ใหญ่จากมากไปน้อย และผู้ชายที่ทานยาปฏิชีวนะก็ไม่มีความเสี่ยงเพิ่มขึ้นที่จะเป็นมะเร็งทวารหนัก ในขณะที่ผู้หญิงที่ทานยาปฏิชีวนะนั้นมีอุบัติการณ์ของมะเร็งทวารหนักลดลงเล็กน้อย